公司從之前對勞工一直有違反勞基法的行為， 今年因有人提出檢舉，所以公司已有改善， 若現在提離職還可依因公司曾經違反勞基法為由提出請求離職嗎?

您好: 我是醫療人員，於101年3月參加某醫學中心"自費"麻醉訓練為期一年， 但在101年12月轉為"公費"訓練，因此共有三個月是有領基本薪資(無績效獎金)，約25000/月，但須簽切結書服務3年。 目前我自簽約算起已在職一年半預離職，細看合約表示須賠償約16萬元，但合約內容有一條表示:自"簽約日"算起訓練一年，訓練完成後需再服務2年，所以共三年，但如前述，我在101年3月~12月是自費受訓，並非101年12月~102年12月，切結書明顯有問題，並且賠款16萬元不是照比例賠償，而是2年內一律全額賠償16萬元，這樣合理嗎? 現在醫療院所都有違反勞基法的行為，我也曾經上過班表排定10小時的班，第8、9個小時醫院並未依法算加班的事實，醫院違法在先，我是否可依醫院違法事實而拒絕付違約金? 若離職時未付違約金，醫院是否有權利不讓我辦理離職手續?(依規定已於一個月前提出) 小蝦米對抗大財團~實在是需要很大點的協助~謝謝!!